Vindo das eiras, onde era debulhado, o cereal chegava à Moagem de Sampaio misturado com impurezas e outras sementes, havendo que proceder à sua limpeza. Este processo ocorria no piso superior do edifício em três máquinas distintas: um combinado de limpeza, uma bandeja despedradora e um trieur. Depois de limpo o cereal era molhado e repousava 10 a 24 horas em tegões.
Nesta zona pode observar-se toda a maquinaria de limpeza em funcionamento.